Optimasi Suhu Annealing Gen Blaz Dari Bakteri Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) Pada Peralatan Medis

Optimization Annealing Temperature Gene blaZ of Bacterial Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Medical Equipment

Authors

  • Lia Listiani Universitas Muhammadiyah Purwokerto
  • Kurnia Ritma Dhanti Universitas Muhammadiyah Purwokerto
  • Kurniawan Kurniawan Universitas Muhammadiyah Purwokerto
  • Oei Stefani Yuanita Widodo Universitas Muhammadiyah Purwokerto

DOI:

https://doi.org/10.33084/bjmlt.v6i1.6083

Keywords:

Annealing, Gene blaZ, MRSA, PCR

Abstract

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus is a strain of S. aureus bacteria that is resistant to methicillin-type penicillins. MRSA bacteria can cause nosocomial infections, which can be spread through medical equipment. One of the genes that encodes the resistance trait of S. aureus is the blaZ gene. The detection of the blaZ gene requires optimizing the annealing temperature of the primer used to obtain the optimal PCR band. This study aims to optimize the annealing temperature for the amplification of the blaZ gene DNA from Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bacteria on medical devices. The method used in this study used a kit for bacterial extraction and Polymerase Chain Reaction(PCR). The results of the blaZ gene DNA amplification in all samples showed clear bands at temperatures of 52.0°C, 54.2°C, 58.7°C, 61.8°C, and 64.0°C; no smears were formed, and the electrophoretic visualization results on the PCR product showed the results of bands that were according to the target, namely 173 bp. The most optimal annealing temperature for amplification of the blaZ gene in MRSA bacteria from hospital medical equipment is 61.8°C.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Amanda, K., Sari, R., & Apridamayanti, P. 2019. Optimasi Suhu Annealing Proses PCR Amplifikasi Gen shv Bakteri Escherichia coli Pasien Ulkus Diabetik. Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran UNTAN. 4(1), 1–6.

Anam, K., Cahyadi, W., Azmi, I., Senjarini, K., & Oktarianti, R. 2021. Analisis Hasil Elektroforesis DNA dengan Image Processing Menggunakan Metode Gaussian Filter. IJEIS (Indonesian Journal of Electronics and Instrumentation Systems). 11(1), 37.

Aulia, S. L., Suwignyo, R. A., & Hasmeda, M. 2021. Optimasi Suhu Annealing untuk Amplifikasi Dna Padi Hasil Persilangan Varietas Tahan Terendam dengan Metode Polymerase Chain Reaction. Sainmatika: Jurnal Ilmiah Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam. 18(1), 44.

Aziz, F., Budi Lestari, F., Nuraidah, S., Purwati, E., Isrina Oktavia Salasia, S. 2018. Deteksi Gen Penyandi Sifat Resistensi Metisilin, Penisilin dan Tetrasiklin pada Isolat Staphylococcus aureus Asal Susu Mastitis Subklinis Sapi Perah. Jurnal Sain Veteriner. 34(1), 60–69.

Devi Astari, D., Gustiani Dewi, S., Setyaningrum, S., & Lidya, B. 2021. Perancangan Primer untuk Deteksi Kandungan Gen Cytochrome b Babi dengan Metode Polymerase Chain Reaction dan Aplikasinya pada Berbagai Produk Industri. Fullerene Journ. Of Chem. 6(2), 110–117.

Erlin, E., Rahmat, A., Redjeki, S., & Purwianingsih, W. 2020. Deteksi Methicilin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Sebagai Penyebab Infeksi Nosokomial Pada Alat-Alat di Ruang Perawatan Bedah. Quagga: Jurnal Pendidikan Dan Biologi. 12(2), 137.

Harahap, M. R. 2018. Elektroforesis: Analisis Elektronika Terhadap Biokimia Genetika. CIRCUIT: Jurnal Ilmiah Pendidikan Teknik Elektro. 2(1), 21–26.

Herman, H., Nainggolan, M., & Roslim, D. I. 2018. Optimasi Suhu Annealing Untuk Empat Primer Rapd Pada Kacang Hijau (Vigna radiata L.). Dinamika Pertanian. 34(1), 41–46.

Muhamad, F., Rafika, S., & Pratiwi, A. 2019. Optimasi Suhu Annealing Gen mecA Resistensi Antibiotik Amoksisilin Dari Bakteri Staphylococcus Aureus Pada Pasien Ulkus Diabetik. Jurnal Kesehatan. 5(1), 12.

Okiki, P. A., Eromosele, E. S., Ade-Ojo, P., Sobajo, O. A., Idris, O. O., & Agbana, R. D. 2020. Occurrence of mecA and blaZ genes in methicillin-resistant Staphylococcus aureus associated with vaginitis among pregnant women in Ado-Ekiti, Nigeria. New Microbes and New Infections. 38, 100772.

Pratiwi, A., Sari, R., & Apridamayanti, P. 2019. Optimasi suhu desain primer gen blaZ resistensi pada bakteri Staphylococcus aureus secara in silico. Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran UNTAN. 4(1), 3–12.

Pratomo, Y. W., Zahida, F., & Yuda, P. 2021. Perbandingan Metode Isolasi DNA sebagai Templat PCR untuk Identifikasi Jenis Kelamin Cerek Jawa (Charadriius javanicus) secara Molekuler Menggunakan Primer 2550F/2718R. Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati. 6(2), 78–86.

Purnomo, N., Ramadhanty, D., Mansur, M., Nur, M., & Dagong, M. I. A. 2021. DNA Quality of Purification from Beef Sausage as Halal Authentication Material Based on Genetic Marker. Jurnal Ilmu Dan Teknologi Peternakan. 9(1), 44–50.

Rosiana, I. W., & Widhiantara, I. G. 2018. Optimalisasi Produk PCR (Polymerase Chain Reaction) Pada Analisa Keragaman Genetik Mikrosatelit Burung Kakatua Kecil Jambul Kuning (Cacatua sulphurea). Jurnal Media Sains. 2(1), 37–42.

Santy Pristianingrum, N., Zainiati, B. L., Muttaqin, Z., Desy Puspita, F., & Arman, R. 2021. Deteksi Metichilin Resistance Staphylococcus Aureus (MRSA). Jurnal Analis Medika Biosains (JAMBS). 8(1), 7–12.

Setyawati, R., & Zubaidah, S. 2021. Optimasi Konsentrasi Primer dan Suhu Annealing dalam Mendeteksi Gen Leptin pada Sapi Peranakan Ongole (PO) Menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR). Indonesian Journal of Laboratory. 4(1), 36.

Sitepu, A. F., Sartini Bayu, E., Aziz, L., & Siregar, M. 2019. Analisis Pola Pita Beberapa Genotipe Kurma (Phoenix dactylifera L.) Menggunakan Primer RAPD. Jurnal Online Agroekotekonogi, 7(3), 502–507.

Sugireng, & Rosdarni. 2020. Deteksi MRSA (Methicilin Resistant Staphylococccus aureus) dengan Metode PCR Pada Pasien Ulkus Diabetikum. Jurusan Biologi, Fakultas Sains Dan Teknologi, UIN Alauddin Makassar. 31–35.

Takayama, Y., Tanaka, T., Oikawa, K., Fukano, N., Goto, M., & Takahashi, T. 2018. Prevalence of blaZ Gene and Performance of Phenotypic Tests to Detect Penicillinase in Staphylococcus aureus Isolates from Japan. Annals of Laboratory Medicine. 38(2), 155–159.

Tilawah, S., Sari, R., & Apridamayanti, P. 2018. Optimasi Volume DNA Marker dan Volume Amplifikasi Gen tetL Resistensi Antibiotik Tetrasiklin dari Bakteri Bacillus cereus pada Pasien Ulkus Diabetik. Jurnal Farmasi. D(6), 1–7.

Turbawaty, D. K., Logito, V., & Tjandrawati, A. 2021. Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Patterns and Antibiotic Susceptibility in Surgical and Non-Surgical Patients in a Tertiary Hospital in Indonesia. Majalah Kedokteran Bandung. 53(3), 148–154.

Turrahmi, M., Nurhidayani, N., Hasyimuddin, H., & Pabendon, M. B. 2021. Uji Kualitas Dan Kuantitas Tanaman Jewawut (Setaria italic) di Balai Penelitian Tanaman Serealia Kabupaten Maros. Filogeni: Jurnal Mahasiswa Biologi. 1(2), 57–62.

Yuenleni, Y. 2019. Langkah-Langkah Optimasi Pcr. Indonesian Journal of Laboratory. 1(3), 51.

Yustinadewi, P. D., Yustiantara, P. S., & Narayani, I. 2018. Mdr-1 Gene 1199 Variant Primer Design Techniques in Pediatric Patient Buffy Coat Samples With LLa. Metamorfosa: Journal of Biological Sciences. 5(1), 105.

Zehra, A., Singh, R., Kaur, S., & Gill, J. P. S. 2017. Molecular characterization of antibiotic-resistant Staphylococcus aureus from livestock (bovine and swine). Veterinary World. 10(6), 598–604.

Downloads

Published

2023-10-31

How to Cite

Listiani, L., Dhanti, K. R., Kurniawan, K., & Widodo, O. S. Y. (2023). Optimasi Suhu Annealing Gen Blaz Dari Bakteri Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) Pada Peralatan Medis: Optimization Annealing Temperature Gene blaZ of Bacterial Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Medical Equipment. Borneo Journal of Medical Laboratory Technology, 6(1), 420–425. https://doi.org/10.33084/bjmlt.v6i1.6083